Το 1979 ο νόμος υποχρέωσε τις ομάδες της Α’ Εθνικής να γίνουν Ποδοσφαιρικές Ανώνυμες Εταιρείες. Το πλειοψηφικό πακέτο (54%) της νέας ΠΑΕ Παναθηναϊκός απέκτησε η οικογένεια Βαρδινογιάννη, με πρωτοβουλία του Γιώργου Βαρδινογιάννη.
Τρεις δεκαετίες στο τιμόνι
Στα 21 χρόνια που ο Γιώργος Βαρδινογιάννης ήταν επικεφαλής, ο Παναθηναϊκός κατέκτησε πρωταθλήματα (1984, 1986, 1990, 1991, 1995, 1996), Κύπελλα και έφτασε σε ευρωπαϊκά ημιτελικά: απέναντι στη Λίβερπουλ το 1985 και στον Άγιαξ το 1996. Το 2000 ανακοίνωσε την αποχώρησή του και τη διοίκηση ανέλαβε ο Γιάννης Βαρδινογιάννης, με πρόεδρο τον Άγγελο Φιλιππίδη.
Το 2008 η οικογένεια άνοιξε την ΠΑΕ σε νέους μετόχους με αύξηση μετοχικού κεφαλαίου, και το 2012 οι μετοχές μεταβιβάστηκαν στην «Παναθηναϊκή Συμμαχία», με πρόεδρο από τον Νοέμβριο του 2012 τον Γιάννη Αλαφούζο.
Ο Γιώργος Βαρδινογιάννης, ο «Καπετάνιος», έφυγε από τη ζωή στις 16 Οκτωβρίου 2026, σε ηλικία 90 ετών, αφήνοντας πίσω του μια από τις πιο πολυσυζητημένες αλλά και πιο πετυχημένες περιόδους της ιστορίας του συλλόγου.