Το καλοκαίρι του 1963 ανέλαβε τον Παναθηναϊκό ο Γιουγκοσλάβος Στέφαν Μπόμπεκ. Έφερε μαζί του το 4-3-3, ένα σύστημα σχεδόν άγνωστο τότε στην Ελλάδα, και η ομάδα «πέταξε».
Ο πρώτος αήττητος πρωταθλητής
Τη σεζόν 1963-64 το τριφύλλι κατέκτησε το πρωτάθλημα με 24 νίκες και 6 ισοπαλίες, χωρίς καμία ήττα. Ήταν το πρώτο αήττητο πρωτάθλημα στην ιστορία της Α’ Εθνικής, μια επίδοση που έμεινε μοναδική για 55 χρόνια.
Και ξανά το 1965
Η επόμενη σεζόν ήταν σχεδόν εξίσου εντυπωσιακή: 20 νίκες, 9 ισοπαλίες και μία μόνο ήττα (3-2 από τον Εθνικό στον Πειραιά, στις 18 Οκτωβρίου 1964). Ο Τάκης Οικονομόπουλος έμεινε ανέπαφος για 1.088 λεπτά, ρεκόρ εποχής, και ο τίτλος σφραγίστηκε στις 6 Ιουνίου 1965 με 1-0 επί της ΑΕΚ στη Λεωφόρο.